VšĮ Vilniaus universitetinė Antakalnio ligoninė savo veiklą viename seniausių ir gražiausių Vilniaus miesto rajonų pradėjo 1966 metais. Tuomet ji vadinosi Sveikatos Apsaugos ministerijos Ketvirtosios valdybos respublikine ligonine, 1990 metais buvo pervardinta Sveikatos apsaugos ministerijos Respublikine Vilniaus 2-ąja ligonine, o 1991 metais – Vilniaus universitetine Antakalnio ligonine. Tai daugiaprofilinė ligoninė, turinti ir savo polikliniką.
Stacionare funkcionuoja šių profilių skyriai:
Ligoninėje veikia hemodializės skyrius, kuriame atliekama per 7000 hemodializių per metus, bei peritoninės dializės poskyris. Kol kas tik mūsų ligoninėje ir Kauno medicinos universiteto klinikose visiems šalies ligoniams pradedamos peritoninės dializės (įsiuvami PD kateteriai, ligoniai apmokomi atlikti peritoninę dializę tiek rankiniu, tiek aparatiniu būdu).
Poliklinikoje, be pirminės sveikatos priežiūros, kurią atlieka gydytojų komanda (apylinkių terapeutai, chirurgai, ginekologai, odontologai), ir pirminės psichikos sveikatos priežiūros tarnybos, dirba gydytojai konsultantai: okulistai, otorinolaringologai, neurologai, endokrinologai, dermatologai, kardiologai, darbo medicinos gydytojas, nefrologas, urologai, reabilitologai. Veikia Respublikinis alergologijos centras, konsultuojantis ligonius iš visos respublikos, epileptologijos kabinetas, kuriame konsultuojami ligoniai ir atliekamas visų Vilniaus apskrityje sergančių epilepsija ligonių monitoringas. Poliklinikoje taip pat dirba odontologinės ortopedijos (dantų protezavimo) skyrius.
Gana gera ligoninės diagnostinė bazė: čia veikia rentgenodiagnostinis skyrius, instrumentinės diagnostikos (echo ir endoskopijų), klinikinės fioziologijos skyriai. Klinikinės diagnostikos laboratorijjoje yra klinikos, biochemijos, imunologijos bei mikrobiologijos poskyriai.
Ligoninė taip pat turi gerą reabilitacinę bazę – fizkultūros salę, baseiną, čia atliekamos vandens, parafino – ozokerito šiluminės ir kitos procedūros. Ligoninės teritorijoje iš 490 m. gylio gręžinio trykšta mineralinis vanduo, kuris naudojamas gydomosioms vonioms (šiuo metu laikinai neveikia).